Le sénat de l’Académie Leopoldina représente les intérêts des membres de l’Académie devant le présidium en plus de conseiller ce dernier. Chaque membre représente une section de l’Académie. En outre, deux membres élus représentent les membres de l’Académie en Autriche et en Suisse. Les membres du sénat sont élus pour un mandat renouvelable de quatre ans.

Le sénat se réunit habituellement une fois par an. Pendant ces réunions, il élit les membres du présidium et les membres honoraires conformément aux règlements. Il examine les rapports annuels du présidium et approuve les mesures prises, nomme les auditeurs et statue sur l’expulsion des membres. Le sénat approuve en outre les règlements sur l’élection des membres de l’Académie, des porte-parole, des représentants régionaux, des membres du sénat et de leurs suppléants, ainsi que des membres du présidium. Il approuve également les règlements structurels régissant les sections et les territoires qui y sont rattachés.